集裝箱運輸擴大了運輸單元，規范了單元尺寸，使得貨物的裝卸、移動、搬運容易實現機械化、自動化，提高了貨物的裝卸效率、碼頭使用效率，擴大了港口的吞吐能力，也減輕了勞動強度。而這種單元又具有一定的規格和強度，集裝箱運輸具有件雜貨運輸無法相比的優越性。它在短短的二十多年間，就基本取代了件雜貨班輪運輸。主要優點歸納如下：

1.提高裝卸效率，減輕勞動強度，提高港口吞吐能力。

2.提高貨物運輸質量，減少了貨損貨差現象。在采用集裝箱運輸時，可以在工廠、倉庫、場地或集裝箱貨運站直接將貨物裝進這種強度較高、水密性較好的集裝箱內，箱體對貨物進行保護，貨物在搬運、移動和裝卸過程中不易損壞，不怕風吹雨淋，裝箱后鉛封，途中丟失的可能性大大降低，貨物完好率大大提高。

3.縮短貨物在途時間，加速車船的周轉，降低營運成本。由于集裝箱交接方式多采用“堆場到堆場（CYtoCY>”的方武，以及集裝箱號的唯一性，給港口和堆場的機械化、自動化、標準化創造了條件。標準貨物單元使裝卸搬運動作變得規范、簡潔，使集裝箱從堆場發放空箱開始，到裝箱、重箱進港、落箱至泊位、移動泊位到上船，每個環節都充分發揮裝卸設備、搬運設備的能力，實現機械化作業。

4.有利于組織多種運輸方式的聯合運輸。集裝箱班輪運輸作為一種標準運輸單元的出現，使運輸工具運載尺寸向統一的滿足集裝箱運輸需要的方向發展，標準化集裝箱設計使運輸工具之間的換裝銜接變得更加便利，這樣有利于組織多種運輸方式的聯合運輸，如海空聯運、陸海聯運、海鐵聯運等，促進了運輸大系統的合理化。另外，集裝箱運輸與托盤及其他集裝單元相結合，使得貨物的管理、運輸、倉儲、分送等的機械化作業效率提高，經濟成本降低。

5.推動包裝的標準化。集裝箱作為一種國際性、統一性的大型標準化運輸設備，它的使用和發展直接規范了一大批商品的標準化，在我國有許多包裝標準都與集裝箱的標準相適應。